Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h7bF8VPP8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms