Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17654F7AXR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17654F7AXR3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17654F7AXR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms