Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8220F6YKI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms