Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10563F6WIE4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10563F6WIE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms