Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21974F6W3F3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21974F6W3F3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms