Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17555F6U8B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17555F6U8B9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17555F6U8B9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms