Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29094F6Q785 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms