Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4E9QAP7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms