Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cald1E9QA15 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cald1E9QA15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms