Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp17lbE9Q9U0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17lbE9Q9U0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms