Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700113H08RikE9Q9Q5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700113H08RikE9Q9Q5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms