Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcmdc2E9Q956 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcmdc2E9Q956 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcmdc2E9Q956 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcmdc2E9Q956 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcmdc2E9Q956 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms