Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp31E9Q6Y8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms