Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC030500E9Q6W0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.1 ms