Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Simc1E9Q6E9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms