Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms