Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgbd1E9Q492 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pgbd1E9Q492 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgbd1E9Q492 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgbd1E9Q492 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgbd1E9Q492 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms