Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd2E9Q3C1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2cd2E9Q3C1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd2E9Q3C1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms