Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt90E9Q1Z0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms