Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Zfp558E9Q1J0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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