Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3893E9Q1I1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms