Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms