Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms