Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx60E9PZQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms