Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Scaf11E9PZM7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf11E9PZM7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms