Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5415E9PXF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms