Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp54bE9PXC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms