Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rsf1E9PWW9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rsf1E9PWW9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rsf1E9PWW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms