Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931408C20RikE9PWP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms