Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3002E9PW72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms