Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc17E9PVB5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms