Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms