Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim5E9PV98 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms