Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifit3bE9PV48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifit3bE9PV48 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms