Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FgaE9PV24 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgaE9PV24 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgaE9PV24 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms