Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syde2E9PUP1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms