Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh8D3Z6W3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms