Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm1330D3Z460 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm1330D3Z460 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms