Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim12cD3Z3L3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms