Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms