Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
3425401B19RikD3Z1D3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
3425401B19RikD3Z1D3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms