Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms