Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc8D3YZV8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms