Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms