Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim30cD3YVI9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim30cD3YVI9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms