Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxpe3B9EKK6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms