Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apol6B7ZC55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol6B7ZC55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.5 ms