Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syce3B5KM66 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Syce3B5KM66 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms