Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia1B2RXQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms