Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26c1B2RXA7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26c1B2RXA7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26c1B2RXA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms